ด้วยสถาบันธัญญรักษ์ ร่วมกับสถาบันพัฒนาและรับรองคุณภาพโรงพยาบาล(พรพ.)ได้จัดทำโครงการพัฒนาและรับรองคุณภาพของสถานบำบัดรักษายาเสพติดทุกระบบ

(ระบบสมัครใจ ระบบบังคับบำบัด และระบบต้องโทษ)เพื่อพัฒนาคุณภาพงานยาเสพติดให้มีคุณภาพตามมาตรฐาน ตลอดจนเสริมสร้างขวัญกำลังใจให้กับผู้ปฏิบัติงานยาเสพติด

ซึ่งเป็นงานสำคัญตามนโยบายของรัฐบาล โดยทางสถาบันธัญญรักษ์ได้จัดคณะนิเทศมาตรวจเยี่ยมสถานฟื้นฟูสมรรถภาพผู้ติดยาเสพติดในระบบต้องโทษในความรับผิดชอบ

ของทัณฑสถานบำบัดพิเศษกลางเพื่อรวบรวมข้อมูลนำเสนอต่อคณะกรรมการพัฒนาและรับรองคุณภาพสถานบำบัดฟื้นฟูสมรรถภาพผู้ติดยาระบบต้องโทษ

ทั้งนี้สถาบันธัญญรักษ์ได้จัดพิธีมอบใบกิตติกรรมประกาศให้กับทัณฑสถานบำบัดพิเศษกลางโดยรับมอบจาก

พลเอกพิจิตร กุลละวณิชย์ องคมนตรี ในการประชุมวิชาการยาเสพติดแห่งชาติ ครั้งที่10 เมื่อวันที่ 20 กรกฎาคม 2552 ณ.อิมเเพค คอนเวนชั่น เซนเตอร์ ฮอลล์ 9 เมืองทองธานี